安徽医科大学附属巢湖医院前身是中国人民解放军皖南军区陆军医院， 1951年9月成立于芜湖市。1952年6月，奉命迁移至肥西张新圩，同年8月集体转业并移交省卫生厅，更名为安徽省第四康复医院。1954年3月，迁到巢湖市现址。1960年7月，更名为安徽省立巢湖医院，隶属省卫生厅。1969年，巢湖行署成立后，医院下放巢湖地区，更名为巢湖地区人民医院。2000年，巢湖撤地设市，医院更名为巢湖市第一人民医院。2006年3月，被评为三级甲等医院。2011年3月，成为安徽医科大学非直属附属医院。2011年9月，因区划调整，医院被划转为合肥市卫生局直属事业单位。2012年12月，经省人民政府批准，医院移交安徽医科大学管理，更名为安徽医科大学附属巢湖医院。经过六十多年的建设和发展，已成为一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等功能为一体的综合性医院。
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　　医院占地面积17万平方米，建筑面积8万平方米。医院编制床位880张，开放床位1021张，设置门诊部2个，临床科室32个，医技科室10个。在岗医护员工1200多人，拥有高级职称110人(其中主任医师23人)、中级职称310人，安徽医科大学硕士点10个，硕士生导师11人。
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　　医院拥有64排和6排螺旋CT、1.5T超导型核磁共振、中能15兆伏直线加速器、DSA、DR、全自动生化分析仪、数字彩超、肺功能仪、人工心肺机、多功能数字化胃肠机、数字化钼靶机、电子胃镜、电子肠镜、胰十二指肠镜、腹腔镜、呼吸机、血透机、手术显微镜、关节镜等大型医用设备，总价值约1.2亿元。
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　　为加强医院内涵建设，提高医疗技术水平，医院全面实施科技兴院战略，注重人才培养和学科建设，逐渐形成了院有特色、科有重点、人有专长的格局，神经外科、普通外科、妇产科、重症医学科是原巢湖市临床医学市级重点学科。医院拥有原巢湖市第五批拔尖人才4人，市第六批拔尖人才2人，市中青年学科带头人3人。近3年获巢湖市科技进步二等奖3项，三等奖1项，通过省级科研成果鉴定4项。
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　　医院坚持“以病人中心”的服务理念，不断改善服务态度，提高服务水平，赢得了社会各界的广泛赞誉，医院的精神文明建设硕果累累。医院先后获得“全国卫生系统先进集体”、“全国百姓放心示范医院”、“全国巾帼文明示范岗”、“全国工会女职工先进集体”、省“十佳医院”、省“医德医风示范医院”和“诚信医院”、省厂务公开民主管理工作先进和示范单位、省“三下乡”先进集体、省青年文明号、省级园林式单位等光荣称号。?

安徽医科大学附属巢湖医院坐落在美丽的巢湖之滨，前身是中国人民解放军皖南军区陆军医院，安徽省第四康复医院，建于1951年9月。1954年3月迁到巢湖市现址。1960年7月，更名为安徽省立巢湖医院。1969年，医院下放巢湖地区，更名为巢湖地区人民医院。2000年，巢湖撤地设市，医院更名为巢湖市第一人民医院。2005年成为安徽医科大学第六临床学院。2006年3月被评为三级甲等医院。2010年成为安徽医科大学非直属附属医院。2012年12月，经省人民政府批准，医院移交安徽医科大学管理，更名为安徽医科大学附属巢湖医院。2014年9月，安徽医科大学实行临床学院与附属医院“院院合一”，医院同时为“安徽医科大学巢湖临床医学院”。2015年4月，安徽医科大学附属巢湖医院成为17家省管医院之一。经过六十六年的建设和发展，已成为一家集医疗、教学、科研、预防、保健、康复等功能为一体的三级甲等省管综合性医院。

医院占地面积16万平方米，医用建筑面积10万余平方米。现有编制床位880张，开放床位1294张，设置门诊部2个，临床科室35个，医技科室13个，教研室22个。年门诊量65万余人次，年收治住院病人4.6万余人次。全院职工总数1512人，卫生技术人员1309人，医药技人员577人，护理人员732人。

医院全面实施创新兴院、人才强院、质量立院三大战略，注重医疗、教学、科研建设。现拥有高级职称118人（其中主任医师35人）、中级职称408人、博士生导师3名、硕士生导师29名。享受国务院及省政府特殊津贴1人，安徽省江淮名医2人，省级以上学会主任委员3人，副主任委员7人。近年来，全院完成省级以上科研立项14项，其中国家自然科学基金项目2项。荣获国家级实用型发明专利4项、省级科技进步二等奖1项、市级科技进步奖1项。近三年已开展国家级继教项目6项、省级继教项目7项，并在各类医学期刊发表论文471余篇，其中SCI论文34篇，中文核心论文37篇。

医院设备齐全，装备精良，拥有64排和6排螺旋CT、1.5T超导型核磁共振、中能15兆伏直线加速器、数字血管减影系统（DSA）、DR、全自动生化分析仪、数字彩超、肺功能仪、人工心肺机、数字化胃肠机、钼靶乳腺机、电子胃肠镜、十二指肠镜、高清腹腔镜、手术显微镜、关节镜等大型医用设备，总价值近2亿元。

医院始终坚持“仁心仁术、求精求新”的办院宗旨，将医院的建设发展成果回馈社会。近年来，医院在抗震救灾，防治传染病，抢救车祸患者等突发公共卫生事件中，出色的完成了医疗救治的职能。医院还积极履行社会责任，大力推进民生工程，开展对口支援帮扶，坚持卫生下乡、下基层，积极为群众义诊、开展健康教育，组织对困难患者捐款捐物等，充分展示了医务人员奉献社会，服务人民的良好精神风貌。医院先后获得了“全国百姓放心示范医院”、“全国医药卫生系统先进集体”、“全国心电图比赛团体三等奖”、“安徽省劳动竞赛先进集体”、“安徽省 ‘致敬白衣天使?精彩故事——百优医生、百优护士’荣誉称号”、“安徽省新生儿窒息复苏知识与技能竞赛团体二等奖”、“安徽省高校附属医院首届青年医师临床技能竞赛团体三等奖”、 “安徽省第一届普外科腹腔镜技能大赛团体三等奖”、“安徽医科大学第三届大学生临床技能竞赛二等奖”、“巢湖市十大感动人物”、“巢湖市最美劳动者”等光荣称号。