半夜结石痛要及时的到医院检查，在医生的指导下服用缓解疼痛的药物，也可以服用排结石的药物和抗生素来治疗，必要的时候还需要通过体外碎石治疗。

1、缓解疼痛的药物：半夜结石痛，主要是由于结石在移动，就会出现疼痛的症状，通常可以服用阿托品、山莨胆碱等，阿托品主要能够来缓解内脏绞痛，改善微循环和抑制腺体分泌，并扩大瞳孔，就能改善疼痛。山莨胆碱通常能够达到平滑肌明显松弛，并能解除微血管痉挛，从而达到镇痛的作用。

2、排结石的药物：如果结石比较小，可以通过用排石颗粒、肾石通颗粒，服用药物以后通常能够促进输尿管蠕动，还可以帮助清热下火，从而达到排石的效果。

2、体外碎石治疗：肾结石患者如果做CT或者彩超检查明确结石大于两厘米，需要通过体外震波碎石治疗，主要是用于三维B超电脑靶向定位跟踪，能够瞬间破坏结时间壳的外壳，从而使结石层层粉碎，从而能够达到彻底治愈结石。

在治疗期间，需要多喝一些温开水，有利于较小的结石排出。