剖宫产妇女绝经后阴道萎缩情况比自然分娩的妇女严重，对性生活有一定影响。发达国家的人们重视中老年性生活，因此在年轻时便注意避免剖宫产。
2、子宫出血剖宫产可令子宫收缩乏力发生率增加，从而造成术后出血增多。
3、羊水栓塞手术中羊水可能进入血液循环，引发严重的过敏反应及栓塞，极其凶险。虽然现在的剖宫产会在操作中通过压住血管后让羊水排净的做法将这种风险降到最低，但羊水栓塞的严重后果仍让产科医生不得不保持高度警惕。
4、感染粘连手术增加了感染机会，手术切口感染、子宫内膜炎、泌尿道感染是常见的三种术后感染。由于手术对人体的损伤，术后容易造成盆腔粘连，埋下肠道蠕动减少甚至梗阻等隐患。
5、麻醉并发症剖宫产需要麻醉，也存在一定的风险。此外，手术过程会损伤神经，造成术后长期“隐隐痛”;还可能损伤产妇的膀胱、输尿管和肠道;少数情况还会出现切口疝(内脏如肠子等从切口突出来)。
6、误吸羊水胎儿在子宫内有吞服羊水的生理现象，但抗胃食管反流结构没有发育成熟，婴儿在剖宫产中没有受到产道的挤压把上消化道的羊水挤干净，在取出母体后的3-5分钟时，约有0.7%的婴儿会误吸羊水到肺部，引起严重的肺炎甚至窒息。尽管用“手托法”等措施可以防止这个并发症，但风险难以100%避免。
7、情商受损在新生儿的神经-行为评分中，剖宫产儿在第7天和第14天得分均低于阴道分娩儿。在远期，国外研究证实剖宫产儿的情商(EQ)会比较低，其可能的原因是剖宫产儿没有经过产道对大脑颞叶的挤压刺激，而颞叶是与情绪相关的神经中枢。郭会平表示，剖宫儿与人交流的能力相对较弱，在幼年容易出现孤独症，现在大学生中很多情感、自杀的问题也许跟剖宫产有关。此外，剖宫产中的手术器械和操作还容易造成婴儿皮肤划伤和骨折;根据人工推算的手术日期还可能与实际孕龄不符，造成人为的早产。
